哈尔滨历史上曾发生过多次疫情，其中较为典型的两次疫情传播源情况如下。2020年4月，黑龙江省政府新闻发布会通报，经中国疾控中心、哈尔滨医科大学等专家调查分析，现有研究结果更支持从美国归来的留学生韩某为此轮疫情反弹的传播源。当时黑龙江省疾控中心将有关两个批次采样送至中国疾控中心进行全基因组测序，获得21人的全基因组序列数据。专家对这些数据进行分析发现，基因组序列间99.99%一致，其中18个人的基因组完全相同，另外三人仅相差1-2个核苷酸，确定为1个传播链，证明病毒通过一个人传开。同时，该传播链的新冠病毒基因组序列与中国人群中以往测过的病毒基因组序列明显不一样，测序结果支持传播源来自国外，是境外输入病例，综合基因组测序分析、流行病学调查证据关联等信息，更支持韩某是此次疫情反弹的传播源。

2021年9月，哈尔滨市出现新增新冠病毒阳性感染者。当时在第一例感染者出现后，紧急排查其近期接触人员，发现了一个多月前从菲律宾回国的病例。这两名病例于8月3日从菲律宾尼诺阿基诺机场乘坐5J308次航班至广州白云机场，入境后在广州隔离14天，8月18日乘坐JD5165次航班到哈尔滨太平国际机场，返至巴彦县家中，居家隔离至9月1日。9月7日，另一病例从江西抵达哈尔滨，与这两名回国人员相聚，后被检测出阳性，排查密接人员时发现这两名回国人员检测结果也为阳性。从他们8月3日回国到9月21日被检测出阳性，已过去49天。不过，当时对于此次疫情的具体源头，虽怀疑与这两名从菲律宾回国的病例有关，但从序列角度分析，在delta全球大流行的情况下，难以区分病毒是新加坡还是菲律宾毒株，甚至无法确定最初发现的几个病例就是源头，经过多日流调和排查，此次疫情源头很难确定。

这些疫情事件反映出境外输入仍是疫情防控的重要风险点，病毒的传播具有复杂性和不确定性，后续仍需持续加强入境人员管理和疫情监测工作。