北京曾在2020年6月经历过一波疫情反弹，从6月11日至6月26日的16天内累计报告本地确诊病例297例，所有病例均在院接受治疗。这波疫情主要集中在丰台区和大兴区，其中丰台区占比最高，仅6月26日当天就新增15例确诊病例，大兴区新增2例。当时全市14个区中，平谷区自疫情以来始终无报告病例，延庆区、怀柔区等12个区已连续超过10天无新增，而海淀区和昌平区仅1天无新增，显示疫情存在区域聚集性。值得注意的是，这波疫情中患者住院时间显著延长，16天内仅1例治愈出院。北京地坛医院院长李昂解释，这并非治疗效率降低，而是对疾病认识深化后采取更系统的治疗方案，同时严格执行出院标准——需临床症状消失后连续两次核酸检测阴性（间隔24小时），且部分医院对采样和检测流程把控更严，减少假阴性风险。中国疾控中心专家吴尊友当时指出，虽然每日仍有新增报告，但多数病例感染发生在6月12日之前，疫情已得到控制，后续新增属于“拖尾现象”。这一阶段的疫情应对也反映出核酸检测的复杂性。曾出现一名患者前4次咽拭子检测均为阴性，第5次才确诊的情况，暴露出采样操作、试剂盒灵敏度等因素对检测结果的影响。为此，北京在发热门诊推行“1+3”检测模式（核酸+血清抗体+影像学+血液检测），以降低漏诊风险。尽管疫情带来挑战，但严格的防控措施最终使北京在后续实现连续多日零新增，逐步恢复正常生产生活秩序。