吉林市曾在不同时期出现过本土确诊病例的波动。2022年3月6日，吉林市新增本土确诊病例42例，其中41例为轻型，1例由无症状感染者转为普通型，同时新增无症状感染者5例。所有感染者均被转运至定点医疗机构隔离治疗，相关密接和次密接人员已被追踪排查并落实管控措施，生活和工作场所也进行了终末消毒。而在2025年5月23日，吉林市新增本地确诊病例1例，该病例是在控制范围内主动筛查时发现的。患者为女性，1988年出生，是此前通报的丰满区确诊病例的密切接触者，住址位于船营区，通过密切接触者主动筛查核酸检测阳性后被诊断为确诊病例。截至当时，吉林省累计报告本地确诊病例136例，累计治愈出院109例，在院隔离治疗25例（均在吉林市），病亡2例，现有重型病例3例（吉林市）。这两次疫情情况反映出吉林市在不同阶段的疫情防控态势，当地政府均采取了相应的隔离管控、追踪排查和医疗救治措施，以应对疫情的变化。