福建曾出现过两次本土确诊病例显著增加的情况。2022年3月19日0至16时，全省新增本土确诊病例112例，其中泉州95例，莆田13例，厦门3例，漳州1例，同时新增本土无症状感染者72例，泉州占68例。自3月11日至19日，全省累计报告本土确诊病例590例，无症状感染者307例，且均在住院或隔离医学观察中。

另一次是在2025年9月18日，福建新增本土确诊病例43例，均集中在厦门（39例）和莆田（4例），无新增无症状感染者。自9月10日至18日，累计报告本土确诊病例335例，住院335例，尚有6704名密切接触者接受医学观察。这两次疫情均体现出地区聚集性，泉州和厦门、莆田分别成为不同时期的疫情中心，当地通过严格的隔离管控和核酸检测等措施应对疫情。