2022年3月，吉林省遭遇了由奥密克戎BA.2变异株引发的疫情，病毒传播隐匿且传染性强，导致疫情在短时间内快速扩散。其中，吉林农业科技学院成为疫情焦点，出现聚集性疫情暴发，3月10日，该校紧急转运6556名学生及85名带队老师，调运近300台大巴车将学生分别转运至吉林市及省内其他多个城市进行隔离，随后学校进行全面消杀。此次事件暴露出学校在疫情初期隔离措施不科学、生活物资保障不足等问题，该校党委书记张立峰因此被免职。

疫情发生后，吉林省迅速采取严格防控措施，3月8日起暂停省内一切聚集性活动，加强社会面管控和出省通道管控。3月14日，吉林省禁止本省人员跨省、跨地区流动，以减少疫情外溢风险。针对疫情传播特点，吉林省推广“抗原筛查、核酸诊断”监测模式，紧急订购1200万人份抗原检测试剂，同时加快方舱医院建设，吉林市增建3家方舱医院共1万张床位，长春也通过改造医院和建设方舱医院等方式增加床位储备。

在疫情发展过程中，吉林省面临医疗资源紧张、流调溯源困难等挑战。奥密克戎BA.2变异株感染者多为无症状或轻症，早期难以发现，导致病毒在社区隐匿传播。同时，疫情正值春季开学季，人员跨区域流动增加，部分农村地区因聚餐、集市等活动加速了疫情传播。为应对这些问题，吉林省加强了核酸检测和流调工作，吉林市、长春市分别完成多次全员核酸检测，并实行省委常委及副省长包保责任制，压实各地防控责任。

经过一个多月的努力，吉林省疫情得到有效控制。4月28日起，长春市逐步解除社会管控，有序恢复正常生产生活秩序，吉林市全域调整为低风险地区，长春机场客运航班恢复正常运行。此次疫情也促使吉林省反思防控工作中的不足，加强了对重点场所、重点人群的防控，完善了疫情应急响应机制，为后续疫情防控积累了经验。